Fase 3A — Protocolo Estatístico Formal (v0.1)**Objetivo:**Avaliar rigorosamente se diferentes classes topológicas de grafos produzem assinaturas espectrais estatisticamente distintas no vetor de observáveis: 27/06/26 09:50 manhã

# CÓDEX: Livro de Bordo
## Fase 3A — Protocolo Estatístico Formal (v0.1)
**Objetivo:**
Avaliar rigorosamente se diferentes classes topológicas de grafos produzem assinaturas espectrais estatisticamente distintas no vetor de observáveis:

### Etapa 0 — Fundação: Pré-registro Analítico
Antes de qualquer execução da bateria de simulações, este protocolo, juntamente com a lista exata de grafos a serem comparados, os parâmetros de rede (N e \langle k \rangle) e as premissas estatísticas, é considerado **congelado**. Nenhuma alteração no critério de falsificação poderá ser feita após a observação dos dados.
### Etapa 1 — Ensemble
Para cada classe topológica:
 * Gerar réplicas independentes.
 * Controlar rigorosamente:
   * Número de nós (N).
   * Grau médio (\langle k \rangle).
 * Utilizar o protocolo de convergência baseado em:
   * Algoritmo de Welford para atualização de variância.
   * Verificação de estabilidade em lotes.
   * Critério de estabilização das médias/variâncias (< 1\%).
### Etapa 2 — Padronização Espacial
Calcular o Z-score para cada métrica i do vetor em relação ao modelo nulo:


Onde ER representa o *ensemble* de Erdős–Rényi gerado com as mesmas restrições macroscópicas (N, \langle k \rangle).
### Etapa 3 — Teste Multivariado Global (Gatekeeper)
 * **Hipótese Nula (H_0):** Os centroides multivariados das classes são idênticos no espaço padronizado.
 * **Hipótese Alternativa (H_1):** Pelo menos uma classe topológica apresenta uma assinatura espectral multivariada distinta.
 * **Procedimento:** PERMANOVA.
 * **Métrica de Distância:** Euclidiana sobre os vetores dos Z-scores.
 * **Resolução:** 9.999 permutações (p_{\min} \approx 0{,}0001).
 * **Nível de Significância Global:** \alpha = 0{,}01.
### Etapa 4 — Verificação de Premissas (Dispersão)
Antes da interpretação do resultado da PERMANOVA:
 * Verificar a homogeneidade das dispersões multivariadas entre os grupos (via PERMDISP ou método equivalente).
 * Registrar a magnitude e o tamanho do efeito de eventuais divergências de dispersão.
 * *Nota cautelar:* Se houver heterogeneidade severa, o resultado da PERMANOVA deverá ser interpretado e documentado explicitamente sob a ótica de diferenças de dispersão, não apenas de localização de centroide.
### Etapa 5 — Decomposição Univariada (Apenas se p < 0{,}01 na Etapa 3)
 * Realizar testes univariados independentes para cada componente do vetor (R, IPR, \gamma_{\rm spec}, \tilde{S}_{\rm spec}).
 * **Método:** Teste t de Student ou Mann–Whitney U, condicionado à verificação prévia de normalidade e homocedasticidade das distribuições marginais.
### Etapa 6 — Correção para Múltiplos Testes
 * **Procedimento:** Correção de Benjamini–Hochberg (BH).
 * **Controle da False Discovery Rate (FDR):** q = 0{,}05.
 * **Registro Obrigatório:**
   * Valores-p nominais (brutos).
   * Valores-p ajustados (p_{\text{adj}}).
   * Tamanho do efeito (ex: d de Cohen para paramétrico, \delta de Cliff ou \eta^2 para não-paramétrico).
### Etapa 7 — Interpretação e Visualização
Caso sejam detectadas diferenças estatisticamente significativas:
 * Identificar quais componentes isolados possuem a maior contribuição (maior tamanho de efeito) para a separação das classes.
 * **Regra da PCA:** A Análise de Componentes Principais (PCA) ou métodos de redução de dimensionalidade similares serão utilizados **exclusivamente como ferramentas de visualização exploratória**, jamais como evidência estatística principal de separabilidade.
### 🛑 Critério Final de Falsificação da Hipótese H2
A Hipótese H2 (que a topologia dita a assinatura espectral de forma previsível) **somente** será considerada provisoriamente corroborada (não falsificada) se **todas** as condições a seguir forem satisfeitas simultaneamente:
 1. A PERMANOVA global resultar em **p < 0{,}01** (calculado via 9.999 permutações).
 2. A premissa de homogeneidade das dispersões (PERMDISP) for aceita ou, caso violada, as diferenças forem devidamente mapeadas e caracterizadas como secundárias à diferença de localização do centroide.
 3. Pelo menos um dos componentes univariados permanecer estatisticamente significativo após a correção de **Benjamini–Hochberg (q=0{,}05)**.
 4. O tamanho do efeito para as métricas significativas for relatado, demonstrando impacto prático, evitando conclusões baseadas unicamente na significância do valor-p.
 5. O padrão de diferenciação espectral for reproduzido de maneira consistente em execuções independentes da bateria computacional.

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